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Precision for Medicine
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Hélix d'ADN Hélix d'ADN

Biospécimens caractérisés par NGS

Des milliers d'échantillons caractérisés par NGS dans plus de 20 indications oncologiques
Precision a créé une vaste collection de biospécimens oncologiques caractérisés par NGS. Ces échantillons biologiques peuvent inclure des tissus tumoraux, normaux et adjacents, de l'ADN/ARN, des images H&E et des données de caractérisation détaillées.

Bibliothèque d'échantillons biologiques caractérisés par NGS de Precision for Medicine

Détails de la bibliothèque

Détails de la bibliothèque

13K+ échantillons biologiques

23 indications en oncologie

Séquencé via :

  • Test de précision Oncomine

  • test truSighttm oncologie 500

Types d'échantillons biologiques

Types d'échantillons biologiques

Blocs FFPE : Tumeur, tissu normal et tissu adjacent

Images H&E pour chaque échantillon

ADN/ARN isolé pour la plupart des échantillons

Portail électronique du laboratoire de précision

Données disponibles

  • Données de caractérisation

  • Rapport de pathologie chirurgicale

  • Sous-type histologique

  • Grade/stade

  • Données démographiques

Nombre total d'échantillons

Graphique

Détails de la bibliothèque de Precision de deux indications d'échantillons biologiques caractérisés par NGS : données de variantes pour les échantillons biologiques de cancer du poumon et de cancer colorectal.

Biospécimens de cancer du poumon par variante

Graphique 2

Biospécimens de cancer colorectal par variante

Graphique 2

Plongée dans les données de caractérisation du cancer du poumon

Biospécimens de cancer du poumon par sous-type de cancer

graphique3-sous-type de cancer

Biospécimens de cancer colorectal par variante

chart3-qc-metrics

Échantillons biologiques caractérisés par NGS et données disponibles :

1. Lames de tissus FFPE

photo1_1
photo1_2

2. Données de caractérisation

Le tableau ci-dessous présente des exemples de données disponibles. Les données supplémentaires (non montrées) comprennent : Procédure chirurgicale, stade, données démographiques, % de tumeur, % de nécrose, analyse NGS.

Exemple de données sur les échantillons caractérisés NG

3. Images H&E

photo2

4. ADN/ARN

photo3

Autres méthodes disponibles pour analyser et caractériser les échantillons biologiques

En plus d'une sélection de biospécimens caractérisés de haute qualité, Precision fournit des services de laboratoire spécialisés pour évaluer ces biospécimens à l'aide de plusieurs technologies, y compris :

  • IHC et mIF

    • Leica BOND
    • Dako Omnis, Dako Link 48, Artisan
    • Ventana BenchMark
    • Akoya Phenolmager™ HT
    • Services de pathologie

  • Pathologie numérique et numérisation de lames

    • Proscia Concentriq
    • Aperio GT 450
    • Aperio AT2
    • 3DHISTECH

  • NGS et génomique

    • NGS : plateformes multiples
    • NanoString
    • ddPCR, qPCR
    • 10x génomique

En savoir plus sur les utilisations des échantillons biologiques caractérisés

Whitepaper

Characterized Biospecimens: A Guide for Leveraging Deeply Characterized Biospecimens

Download Whitepaper
Characterized Biospecimens: A Guide for Leveraging Deeply Characterized Biospecimens
iStock-1888883171

Bioréférentiel de tissus de Precision

Le dépôt de tissus de Precision contient plus de 3 millions d'échantillons FFPE et plusieurs millions de lames histologiques couvrant un spectre complet de maladies oncologiques et médicales.

Explorer les échantillons biologiques de tissus de Precision

Panneaux de caractérisation NGS de Precision

Precision utilise le panel TruSight™ Oncology 500 (TSO 500) et le panel Oncomine Precision Assay (OPA) pour caractériser les échantillons biologiques en oncologie.

TSO 500 Biomarqueurs sélectionnés

PoumonMélanomeColonOvaireSeinGastraleVessieMyéloïdePan-cancer

AKT1

BRAF

AKT1

BRAF

AKT1

BRAF

MSH5

ALBL1

MSI

ALK

CTNNB1

BRAF

BRCA1

AR

KIT

PMS2

ASXL1

NTRK

BRAF

GNA11

HRAS

BRCA2

BRCA1

KRAS

TSC1

CALR

MSI

DDR2

GNAQ

KRAS

KRAS

BRCA2

MET

MSH5

CESPA

NTRK

EGFR

KIT

MET

PDGFRA

ERBB2

MLH1

PMS2

ETV6

ERBB2

MAP2K1

MLH1

FOXL2

FGFR1

PDGFRA

TSC1

EZH2

FGFR1

NF1

MSH2

TP53

FGFR2

TP53

FLT3

FGFR3

NRAS

MSH5

BRAF

PIK3CA

BRAF

GATA3

KRAS

PDGFRA

NRAS

BRCA1

PTEN

KIT

IDH1

MAP2K1

PIK3CA

PIK3CA

BRCA2

AKT1

KRAS

IDH2

MET

PTEN

PMS2

KRAS

AR

MET

JAK2

NRAS

TP53

PTEN

PDGFRA

BRCA1

MLH1

KIT

PIK3CA

BRAF

SMAD4

FOXL2

BRCA2

PDGFRA

MPL

PTEN

CTNNB1

TP53

TP53

ERBB2

TP53

NPM1

RET

GNA11

AKT1

FGFR1

RUNX1

TP53

GNAQ

BRAF

FGFR2

SF3B1

TMB

KIT

HRAS

PIK3CA

SRSF2

AKT1

MAP2K1

KRAS

PTEN

TP53

ALK

NF1

MET

ALBL1

BRAF

NRAS

MLH1

ASXL1

DDR2

PDGFRA

MSH2

CALR

EGFR

PIK3CA

MSH5

CESPA

ERBB2

PTEN

NRAS

ETV6

FGFR1

TP53

PIK3CA

EZH2

FGFR3

PMS2

FLT3

KRAS

PTEN

GATA3

MAP2K1

SMAD4

IDH1

MET

TP53

IDH2

NRAS

JAK2

PIK3CA

KIT

PTEN

MPL

RET

NPM1

TP53

RUNX1

TMB

SF3B1

SRSF2

TP53

Biomarqueurs de l'OPA

Points chauds de l'ADN
AKT1
ESR1
MAP2K2

AKT2

FGFR1

MET

AKT3

FGFR2

MTOR

ALK

FGFR3

NRAS

AR

FGFR4

NRTK1

ARAF

FTL3

NTRK2

BRAF

GNA11

NTRK3

CDK4

GNAQ

PDGFRA

CDKN2A

GNAS

PIK3CA

CHEK2

HRAS

PTEN

CTNNB1

IDH1

RAF1

EGFR

IDH2

RET

ERBB2

KIT

ROS1

ERBB3

KRAS

OMR

ERBB4

MAP2K1

TP53

AKT2

FGFR1

MET

AKT3

FGFR2

MTOR

ALK

FGFR3

NRAS

AR

FGFR4

NRTK1

ARAF

FTL3

NTRK2

BRAF

GNA11

NTRK3

CDK4

GNAQ

PDGFRA

CDKN2A

GNAS

PIK3CA

CHEK2

HRAS

PTEN

CTNNB1

IDH1

RAF1

EGFR

IDH2

RET

ERBB2

KIT

ROS1

ERBB3

KRAS

SMO

ERBB4

MAP2K1

TP53

CNV
AKT1

AKT2

AKT3

ALK

AR

ARAF

BRAF

CDK4

CDKN2A

CHEK2

CTNNB1

EGFR

ERBB2

ERBB3

ERBB4

AKT2

AKT3

ALK

AR

ARAF

BRAF

CDK4

CDKN2A

CHEK2

CTNNB1

EGFR

ERBB2

ERBB3

ERBB4

Fusions intergénétiques
ALK
NTRK2

BRAF

NTRK3

ESR1

NUTM1

FGFR1

RET

FGFR2

ROS1

FGRF3

RSPO2

MET

RSPO3

NRG1

 -

NTRK1

 -

BRAF

NTRK3

ESR1

NUTM1

FGFR1

RET

FGFR2

ROS1

FGRF3

RSPO2

MET

RSPO3

NRG1

 -

NTRK1

 -

Fusions intragénétiques
AR

EGFR

MET

EGFR

MET