Services de PCR numérique (ddPCR)
Capacités et applications de la ddPCR de précision
Precision utilise le système Bio-Rad QX200™ ddPCR™ pour les essais de PCR numérique - qui, en plus d'une précision et d'une sensibilité élevées, présente une évolutivité permettant de réaliser des analyses à haut débit. En outre, le système ddPCR peut accepter une gamme de types d'échantillons.
Precision possède une expertise particulière dans l'utilisation de la ddPCR pour les applications de thérapie génique et de thérapie cellulaire, tant au stade préclinique que pour l'analyse d'échantillons cliniques.
Applications générales
- Détection de séquences et de mutations rares
- Validation de la NGS avant et après l'exécution
- Détection sensible des variations du nombre de copies (CNV)
- Analyse de cellules uniques
- Analyse de l'expression génétique et des miARN
- Biopsie liquide : cfDNA
Applications de la thérapie cellulaire
- Biodistribution des CAR-T
- Persistance de la thérapie cellulaire / pharmacocinétique
- Mesure du nombre de copies duvecteur (comme estimation de l'efficacité de l'administration du vecteur CAR)
- Test du lentivirus compétent pour la réplication (RCL)
Applications de la thérapie génique
- Biodistribution du vecteur viral
- Excrétion virale
- Excrétion de virus oncolytiques
- Expression transgénique
- Estimation du nombre de copies du vecteur
- Détection des événements d'édition de gènes
Les types d'échantillons compatibles avec la ddPCR comprennent les échantillons à faible abondance et les échantillons difficiles.
- Tissus : frais, congelés, FFPE
- Cellules, exosomes
- Biopsies liquides : Sang, BM, LCR, Salive, Larmes, Urine, cfDNA, cfRNA
Oncologie : Étude de phase 1/2 d'escalade de dose dans les tumeurs solides
Étude visant à déterminer le niveau d'expression de deux gènes ciblés - la qPCR a été demandée. La ddPCR a été recommandée par Precision pour fournir des données plus sensibles et quantifiées avec moins d'échantillons.
Maladies infectieuses : Détection acellulaire de l'ADN du VPH
Biopsie liquide : détection de l'infection à HPV par l'ADN HPV acellulaire. La ddPCR est idéale ici pour la détection de l'ADN acellulaire de faible abondance.
Thérapie génique : Évaluer le nombre de copies du gène d'intérêt dans plusieurs types de tissus
Étude BPL visant à déterminer le nombre de copies du vecteur dans 16 types de tissus chez le PSN. La flexibilité des exigences en matière d'échantillons et la grande sensibilité de la ddPCR sont idéales pour générer des données sur la biodistribution des thérapies géniques.
Services supplémentaires de génomique
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qPCR
Plusieurs plateformes dont le QuantStudio™ 12k Flex avec plaques OpenArray™ pour un criblage rapide et multiplexé de dizaines de gènes et d'échantillons en un seul passage. -
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NGS
Services comprenant le séquençage de l'ARN-seq, le séquençage de l'exome entier et le séquençage ciblé de l'ADN/ARN à l'aide des plateformes NGS d'Illumina et de Thermo-Fisher. -
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NanoString
Panneaux permettant l'analyse simultanée de 800 gènes ; idéal pour les projets nécessitant une analyse hautement multiplexée, tels que l'oncologie et le développement de thérapies auto-immunes.
